यद्यपि परिवहन सेवाओं का राजस्व बढ़ रहा है, फिर भी विभिन्न रियायतों के कारण परिवहन अपेक्षित राजस्व से वंचित रह रहा है। 75 वर्ष की आयु पूरी कर चुके वरिष्ठ नागरिकों के लिए मुफ्त यात्रा, महिलाओं के लिए किराए में 50 प्रतिशत की छूट, विकलांगों और स्कूली छात्रों को दी जाने वाली रियायतों के कारण टीएमटी को प्रतिदिन चार से पाँच लाख और प्रति माह एक से डेढ़ करोड़ का नुकसान हो रहा है। ठाणे के लोगों को तेज़ और सस्ती परिवहन सेवाएँ प्रदान करने के लिए, ठाणे नगर निगम ने एक परिवहन सेवा पहल शुरू की। इस पहल के तहत, ठाणे परिवहन की लगभग 380 बसों में न केवल शहर में बल्कि आसपास के क्षेत्रों में भी तीन से साढ़े तीन लाख यात्री नियमित रूप से यात्रा करते हैं। 

ठाणे मनपा परिवहन के बेड़े में कुल ३६४ बसें हैं। इनमें उपक्रम की अपनी १२४ बसें हैं, वहीं शेष २२० बसें जीजीसी आधार पर ठेकेदारों के माध्यम से चलाई जा रही हैं। कुल ३६४ बसों में से ३०० कोच वास्तव में यात्री सुविधा के लिए उपलब्ध हैं। ठाणे शहर की आबादी २५ लाख से ज्यादा हो गई है।

टीएमटी बसों में यात्रियों को अपनी जान हथेली पर रखकर यात्रा करनी पड़ रही है। दरअसल, टीएमटी के बसों में फायर सेफ्टी की सुविधा नहीं है। इस मामले का पर्दाफाश ठाणे महानगरपालिका परिवहन समिति के सदस्य मोहसिन शेख ने किया है।